MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017812	CTT	2	6	47	52	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858818
2	NC_017812	TAAT	2	8	80	87	50 %	50 %	0 %	0 %	386858818
3	NC_017812	AGC	2	6	93	98	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858818
4	NC_017812	A	6	6	108	113	100 %	0 %	0 %	0 %	386858818
5	NC_017812	GAATA	2	10	161	170	60 %	20 %	20 %	0 %	386858818
6	NC_017812	TCT	2	6	172	177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858818
7	NC_017812	ATTC	2	8	197	204	25 %	50 %	0 %	25 %	386858818
8	NC_017812	GTTT	2	8	256	263	0 %	75 %	25 %	0 %	386858818
9	NC_017812	ATT	2	6	264	269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858818
10	NC_017812	TAA	2	6	308	313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858818
11	NC_017812	TTG	2	6	333	338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858818
12	NC_017812	ATTC	2	8	339	346	25 %	50 %	0 %	25 %	386858818
13	NC_017812	ATT	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858818
14	NC_017812	GTA	2	6	370	375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858818
15	NC_017812	ATTTTT	2	12	378	389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386858818
16	NC_017812	TATG	2	8	421	428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017812	ACA	2	6	429	434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017812	A	6	6	479	484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017812	A	7	7	493	499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017812	TAT	2	6	506	511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017812	AAGT	2	8	512	519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017812	TAGC	2	8	555	562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017812	ATAGC	2	10	563	572	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017812	AATA	2	8	633	640	75 %	25 %	0 %	0 %	386858819
25	NC_017812	TAA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
26	NC_017812	TA	3	6	678	683	50 %	50 %	0 %	0 %	386858819
27	NC_017812	TAA	2	6	824	829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
28	NC_017812	TAT	2	6	831	836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858819
29	NC_017812	TTA	2	6	869	874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858819
30	NC_017812	A	7	7	890	896	100 %	0 %	0 %	0 %	386858819
31	NC_017812	GAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858819
32	NC_017812	AAAG	2	8	927	934	75 %	0 %	25 %	0 %	386858819
33	NC_017812	AATA	3	12	959	970	75 %	25 %	0 %	0 %	386858819
34	NC_017812	TAG	2	6	1001	1006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858819
35	NC_017812	TAA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
36	NC_017812	ATA	2	6	1039	1044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
37	NC_017812	TAA	3	9	1046	1054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
38	NC_017812	AGA	2	6	1055	1060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858819
39	NC_017812	AG	3	6	1185	1190	50 %	0 %	50 %	0 %	386858819
40	NC_017812	AAT	2	6	1251	1256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
41	NC_017812	CAAAG	2	10	1304	1313	60 %	0 %	20 %	20 %	386858819
42	NC_017812	A	8	8	1324	1331	100 %	0 %	0 %	0 %	386858819
43	NC_017812	AT	3	6	1371	1376	50 %	50 %	0 %	0 %	386858819
44	NC_017812	AAGC	2	8	1388	1395	50 %	0 %	25 %	25 %	386858819
45	NC_017812	TAT	2	6	1403	1408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858819
46	NC_017812	A	8	8	1433	1440	100 %	0 %	0 %	0 %	386858819
47	NC_017812	GAA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858819
48	NC_017812	ATA	2	6	1549	1554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
49	NC_017812	AAAC	2	8	1595	1602	75 %	0 %	0 %	25 %	386858819
50	NC_017812	AAT	2	6	1632	1637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
51	NC_017812	TAT	2	6	1644	1649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858819
52	NC_017812	ATT	2	6	1652	1657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858819
53	NC_017812	AGA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858819
54	NC_017812	ATTA	2	8	1713	1720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017812	AGAAA	2	10	1764	1773	80 %	0 %	20 %	0 %	386858820
56	NC_017812	AGA	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858820
57	NC_017812	A	7	7	1847	1853	100 %	0 %	0 %	0 %	386858820
58	NC_017812	CAA	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858820
59	NC_017812	T	8	8	1891	1898	0 %	100 %	0 %	0 %	386858820
60	NC_017812	CA	3	6	1932	1937	50 %	0 %	0 %	50 %	386858820
61	NC_017812	ATGA	2	8	1944	1951	50 %	25 %	25 %	0 %	386858820
62	NC_017812	T	6	6	1992	1997	0 %	100 %	0 %	0 %	386858820
63	NC_017812	TAA	2	6	2018	2023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858820
64	NC_017812	AGA	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858820
65	NC_017812	ATTTA	2	10	2039	2048	40 %	60 %	0 %	0 %	386858820
66	NC_017812	AGA	2	6	2060	2065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858820
67	NC_017812	TAA	2	6	2066	2071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858820
68	NC_017812	TGT	2	6	2114	2119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858820
69	NC_017812	AGA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858820
70	NC_017812	AT	3	6	2211	2216	50 %	50 %	0 %	0 %	386858820
71	NC_017812	TTA	2	6	2241	2246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858820
72	NC_017812	A	6	6	2254	2259	100 %	0 %	0 %	0 %	386858820
73	NC_017812	ATT	2	6	2279	2284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858820
74	NC_017812	AG	3	6	2297	2302	50 %	0 %	50 %	0 %	386858820
75	NC_017812	AGG	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858820
76	NC_017812	AAT	2	6	2386	2391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858820
77	NC_017812	GGT	2	6	2411	2416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858821
78	NC_017812	TAT	2	6	2437	2442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858821
79	NC_017812	ATT	2	6	2452	2457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858821
80	NC_017812	A	7	7	2461	2467	100 %	0 %	0 %	0 %	386858821
81	NC_017812	AAT	2	6	2540	2545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858821
82	NC_017812	AT	4	8	2565	2572	50 %	50 %	0 %	0 %	386858821
83	NC_017812	AAG	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858821
84	NC_017812	TTAAAG	2	12	2696	2707	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386858821
85	NC_017812	T	6	6	2719	2724	0 %	100 %	0 %	0 %	386858821
86	NC_017812	TAG	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858821
87	NC_017812	TTTTAT	2	12	2902	2913	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386858821
88	NC_017812	ATA	2	6	2931	2936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858821
89	NC_017812	A	6	6	2968	2973	100 %	0 %	0 %	0 %	386858821
90	NC_017812	T	6	6	2977	2982	0 %	100 %	0 %	0 %	386858821
91	NC_017812	ATA	2	6	3030	3035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858821
92	NC_017812	TAAA	2	8	3045	3052	75 %	25 %	0 %	0 %	386858821
93	NC_017812	T	8	8	3087	3094	0 %	100 %	0 %	0 %	386858821
94	NC_017812	A	8	8	3095	3102	100 %	0 %	0 %	0 %	386858821
95	NC_017812	TAA	2	6	3124	3129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017812	AGA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858822
97	NC_017812	CAA	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858822
98	NC_017812	ATT	2	6	3271	3276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858822
99	NC_017812	TTA	2	6	3323	3328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858822
100	NC_017812	AG	3	6	3335	3340	50 %	0 %	50 %	0 %	386858822
101	NC_017812	TAT	2	6	3375	3380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858822
102	NC_017812	TAT	2	6	3485	3490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858822
103	NC_017812	ATTAT	2	10	3499	3508	40 %	60 %	0 %	0 %	386858822
104	NC_017812	GAAG	2	8	3549	3556	50 %	0 %	50 %	0 %	386858822
105	NC_017812	A	7	7	3566	3572	100 %	0 %	0 %	0 %	386858822
106	NC_017812	CAAAA	3	15	3574	3588	80 %	0 %	0 %	20 %	386858822
107	NC_017812	AGCA	2	8	3616	3623	50 %	0 %	25 %	25 %	386858822
108	NC_017812	A	8	8	3639	3646	100 %	0 %	0 %	0 %	386858822
109	NC_017812	TTA	2	6	3666	3671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858822
110	NC_017812	TGAAAA	2	12	3683	3694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386858822
111	NC_017812	A	7	7	3716	3722	100 %	0 %	0 %	0 %	386858822
112	NC_017812	GTTT	2	8	3741	3748	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017812	ATT	2	6	3769	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017812	TTA	2	6	3779	3784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017812	TAG	3	9	3839	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017812	TGAT	2	8	3864	3871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017812	T	7	7	3931	3937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017812	T	7	7	3953	3959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017812	TA	3	6	3990	3995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017812	TA	4	8	4000	4007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017812	AAT	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017812	A	6	6	4059	4064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017812	TCAA	2	8	4065	4072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017812	GA	4	8	4081	4088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017812	GTT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858823
126	NC_017812	AT	3	6	4168	4173	50 %	50 %	0 %	0 %	386858823
127	NC_017812	AGA	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858823
128	NC_017812	ACA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858823
129	NC_017812	GAA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858823
130	NC_017812	CAA	2	6	4257	4262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858823
131	NC_017812	ATAA	2	8	4301	4308	75 %	25 %	0 %	0 %	386858823
132	NC_017812	TAT	2	6	4325	4330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858823
133	NC_017812	TAG	2	6	4392	4397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017812	GAT	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017812	CAA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017812	TAATT	2	10	4506	4515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017812	AGT	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017812	N	1218	1218	4563	5780	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017812	ATA	2	6	5786	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017812	TTA	2	6	5843	5848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017812	AGAT	2	8	5850	5857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017812	ATTATG	2	12	5876	5887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017812	TCG	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017812	TGA	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_017812	CTTT	2	8	9710	9717	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.